La logistique est un acteur essentiel dans la gestion des flux internes et externes de l'entreprise. La fonction logistique, dans son acception actuelle, comprend des activités de pilotage des approvisionnements, de la production et de la distribution. En ce sens, c'est une fonction étendue qui est donc présente à de multiples endroits de l'entreprise et, par suite, de l'ERP AGI.
Vis-à-vis de l'extérieur, la logistique sert d'interface à la fois pour les flux entrants et les flux sortants. Ainsi, la réception des pièces expédiées par les fournisseurs constitue le point d'entrée de l'ensemble de la chaîne logistique. Sa parfaite maîtrise est donc cruciale pour le bon déroulement des étapes suivantes. A l'autre bout de la chaîne, la logistique assure l'interface directe avec le client. Elle doit donc être le garant de la satisfaction du client.
Ces flux ne sont cependant pas les seuls à être gérer, il faut également suivre les flux indirects de livraison avec des stocks déportés comme peuvent l'être les stocks de consignation (également appelés MAF, Magasins Avancés Fournisseur).